学院专业办学历史悠久，2004年就学校已经开设了相关专业。2015年顺应当前交通行业发展对人才的需求，从机械和电子学院将几个汽车交通相关强势专业整合组建了汽车与交通工程学院。学院是一个年轻、有活力、有冲力的学院，现有汽车检测与维修、新能源汽车技术、汽车营销与服务、城市轨道交通机电、城市轨道交通运营管理等5个专业，其中，新能源汽车技术专业是江苏省高职院校高水平骨干专业、南通市千亿产业支撑专业、校级特色专业。汽车检测与维修技术专业是教育部现代学徒制试点专业、校级品牌专业，城市轨道交通两个专业与南通轨道交通公司合作办学、订单培养。目前，学院拥有在校生近1000人。
        学院建有功能齐全面积4500多平米的现代化实训中心，江苏省省级职业教育实训基地（新能源汽车）一个、江苏省重点实训中心（汽检实训中心）一个，南通市重点实验室一个（新能源汽车技术实验室）。学院办学实力雄厚，师资队伍优秀，现有专任教师20余人，高级职称6人，博硕士19人，拥有江苏省333中青年学术带头人1名、省青蓝工程中青年学术带头人2名、南通市226人才2名，发展潜力巨大。学院培养的毕业生专业理论体系全面，岗位技能扎实，多次获得江苏省技能大赛的各种奖项，深受用人单位好评。
        学院专业建设秉承“顶天立地”的建设思想，从质量工程项目建设、学生素质素养养成方面两方面入手，取得了一系列成绩：与浙江工业职业技术学院联合主持建设国家唯一的国家职业教育新能源汽车技术专业教学资源库；成为苏中、苏北地区唯一一家参与上汽通用汽车维修服务教育项目（简称ASEP）（教育部备案）的合作院校；建成江苏省重点实训中心（汽检实训中心）；建成江苏省省级职业教育新能源汽车实训基地；建成南通市新能源汽车驱动与智能控制技术重点实验室；成为南通市新能源汽车产业联盟会员单位，上海交通物流职教集团会员单位。学院培养的毕业生爱岗敬业，专业理论体系全面，岗位技能扎实，多次获得江苏省技能大赛的各种奖项，深受用人单位的欢迎。